Habib Muhammed Efendi'nin büyük oğludur.Baba ve oğlun her ikisi de aynı isimlerle isimlendirilmiş olup,birini diğerinden ayırmak için babanın ikinci adı başta, oğlununki de sonda söylenmiştir.Babasının ölümünde alimlerden arası açık olduğundan Erzurum müftüsü olmuştur. Bu makamda 20 sene vazife yapan Muhammed Habib Efendi dedesinden ders okumuştur.Faziletli ve kıymetli oluşuna, büyük oğlu; Feyzullah Efendi' yi yetiştirmiş olması yeterli delildir. Muhterem dedesi Seyyid Pir Muhammed'in,bazı övülecek vasıf ve kerametlerini havi yazmış olduğu matbu olmayan risalesi vardı. Risale,çocuklarının kütüphanesinde I.Dünya Savaşı'na kadar muhafaza ediliyordu.

Muhammed Habib Efendi hicri 1100 (1689) de Ölmüş ve ailesinin yanına defnedilmiştir.